作為世界上最早種植水稻的國家，水稻在我國糧食生產中起著舉足輕重的作用。隨著外國一流育種公司開始重視中國市場，我國大豆、棉花等重要作物的種子市場已先后淪陷。水稻作為我國最重要的糧食作物，是保證我國糧食安全的關鍵。
華大基因李瑞強博士介紹，新中國成立以來，我國的水稻育種水平一直處于世界前列，水稻畝產量先后實現了三次飛躍。盡管我國的雜交水稻技術目前在國際上處于領先地位，但隨著國際育種公司加速基因資源的爭奪、新的優(yōu)質品種不斷涌現，如果不加強分子育種技術研究，我們的水稻育種研究將面臨被國際水平趕超的危險。
我國科學家曾于2002年率先合作完成秈稻基因組框架圖與精細圖的繪制工作，并在國際著名學術期刊《科學》發(fā)表科學專論。華大憑借其世界領先的高通量測序平臺，生物信息學分析平臺和轉基因平臺，力圖推動水稻基因組學研究的另一次革命。目前已完成400多個水稻基因的轉基因克隆工作，依托華大基因強大的高通量測序技術，今后將進一步加快水稻轉基因育種研究工作。
